Pattedyr
Pattedyrsamlingen rummer flere tusinde præparater af skind, kranier, udstopninger, frossent materiale samt DNA-prøver med en hovedvægt på danske pattedyr. En stor del af pattedyrene blev indsamlet i forbindelse med projektet Dansk Pattedyratlas, som fandt sted i år 2000-2003.
I samlingen findes endvidere eksemplarer stillet til rådighed efter forskningsprojekter omhandlende, f.eks. egern, småpattedyr og odder. Desuden findes en større afrikansk samling baseret på museets ekspedition til Østafrika i 1947. Samlingen kurateres af Thomas Secher Jensen.